نشريه «منشور برادری» ارگان سازمان فدائيان اسلام، از تشكل‌های نزديك به مؤتلفه اسلامی به دبيركلی "عبد خدائی” (عامل ترور دكتر حسين فاطمی وزير خارجه مصدق)، با اشاره به «بدنامی دولت صفوی» در تاريخ به خاطر «مقابله با يك دولت به ظاهر مسلمان(عثماني)» و از زاويه مذهبی به مسأله القاعده و حضور اعضای آن در ايران پرداخته و هشدار داده كه اقدام حكومت در مقابل اين گروه تروريستی نبايد به گونه‌ای باشد كه «در دراز مدت بر روابطمان با اهل سنت» تأثير منفی برجای گذارد.

نويسنده مطلب با وقوف بر اقدامات منفی القاعده عليه منافع ايرانيان و شيعيان پرسيده است:«با اين همه هم به لحاظ مذهبی و هم سياسی، مصلحت ما در ارتباط با كسانی از اين تشكيلات كه به هر روی، و به حق يا ناحق مورد علاقه شمار فراوانی از مسلمانان نيز هستند و اكنون در بند ايرانند، چيست؟»

ارگان فدائيان اسلام مدعی شده كه «اروپا و آمريكاييان نيز صرف‌نظر از تمام مسائل سياسی و حقوقی اين حق را به ما مي‌دهند كه ما به لحاظ مذهبی نمي‌توانيم چنين دشمنی عميقی را ميان خود و اكثريت سنی كه در اطراف ما هستند، ايجاد كنيم.»

در پايان مطلب توصيه شده كه «نهادهای مذهبی مربوط در ايران مانند جمع ]جهاني[‌ اهل بيت و دارالتقريب ]مذاهب اسلامي[، همراه با ارگان‌های ذي‌ربط در اين قضايا، بايد در اين سياستگذاری مشاركت كرده و نظريه جامعی را كه بتواند در عين حال كه دشواري‌های سياسی ما را حل مي‌كند، به مصالح مذهبی ما هم توجه داشته باشد، ارائه دهند.»