سيد محمد سلامتی دبيركل سازمان مجاهدين انقلاب اسلامی، هدف از برخورد با اصلاح‌طلبان و دانشجويان را محدودكردن آزادي‌ها اعلام كرد كه بخشی از قوه قضائيه نيز با آن همراهی می كند.  وی با اشاره به سخنان محمد خاتمی در ديدار با نمايندگان مجلس گفت:

نگرانی خاتمی نسبت به اوضاع كشور، تنها وی را دربرنمي‌گيرد، اين نگرانی كنونی همه فعالان سياسی دلسوز به حال نظام دانست.

امريكا در راستای حضورش، مسأله حقوق بشر، انرژی اتمی و مبارزه با تروريسم را مستمسك قرار داده است كه به لحاظ جدي‌بودن اين تهديدات، همه گروه‌ها و احزاب سياسی بايد به صورت جدی به اين مسأله بپردازند.

من نسبت به فعاليت‌های جريان‌های سياسی كه با بي‌توجهی به منافع ملی بر يأس و نااميدی مردم و جوانان از نظام دامن مي‌زنند نگرانم. مسؤولان بايد حركت مشكوك اين جريان‌های سياسی را با دقت بيشتری دنبال كنند، زيرا رفتارهای آن‌ها، يأس و نااميدی را به همراه مي‌آورد كه تهديدی جدی برای كشور به شمار مي‌آيد.

سلامتی با تأكيد بر اين كه قدرت تخريب تهديدات داخلی به مراتب بيشتر از تهديدات خارجی است، افزود: در صورتی كه در داخل كشور، مشكلی وجود نداشته باشد و گروه‌های سياسی با وحدت كامل در چارچوب قانون عمل كنند، به تدريج شرايطی ايجاد مي‌شود كه ضريب قدرت‌طلبی و سرپوش گذاشتن بر خطاها از طريق تحكيم قدرت سياسی دليل اصلی بي‌توجهی برخی از گروه‌ها به منافع ملی است. به همراه انگيزه‌های يادشده، گروه‌هايی نيز وجود دارند كه از خارج خط مي‌گيرند و برای ضربه‌زدن به نظام، عزم جدی دارند كه اين بسيار خطرناك است.