پيرامون ترور قاضی مقدسی، اطلاعات جديدی بدست آمده است. بموجب اين اطلاعات قاضی مقدسی در تدارك انتشار كتاب خاطرات خود از محاكماتی بوده كه وی در اين سالها در آن نقش داشته است. در بخشی از اين كتاب، وی مسائلی را در باره سعيد مرتضوی نوشته كه او از افشای آن بيمناك بوده و به همين دليل اين دو با هم ملاقات می‌كنند. وقتی بحث در باره پرونده گنجی و كنفرانس برلين بالا می‌گيرد، مقدسی به مرتضوی می‌گويد كه اين پرونده ( پرونده گنجی) بايد عودت داده شود به من. مرتضوی مخالفت می‌كند و مقدسی می‌گويد: دراينصورت با مطبوعات مصاحبه می‌كنم!

برخی ناظران دادستانی گفته اند، در پايان اين گفتگوی تند، آنها بسيار تند بر سر هم داد زدند و حتی دست به گريبان شدند. درجريان اين درگيری مقدسی به مرتضوی می‌گويد: سوابق من بيشتر از توست و تو با توطئه و قتل رفتی بالا!

تنها چند روز بعد از اين برخورد، مقدسی ترور شد. جزئيات اين مسائل را خانواده مقدسی می‌دانند و با چند خبرنگار مطبوعاتی نيز در ميان گذاشته اند، اما هيچ روزنامه ای حاضر به مصاحبه با خانواده مقدسی نيست. بحث روز اينست: كتاب خاطرات مقدسی نزد كدام انتشاراتی است و قاضی مرتضوی به آن دست يافته يا نه؟