ظاهرا، علی ربيعی (مشاور امنيتی محمد خاتمی)، سرپرستی تيم بررسی كننده تخلفات انتخابات اخير را برعهده گرفته است. همزمان با اظهارات تند خاتمی در قم، پيرامون تخلفات و تخريب های انتخابات اخير، علی ربيعی در تهران گفت: با مستنداتی كه تاكنون در اين خصوص (تخلفات انتخاباتی) مشاهده كرده‌ام، به طور قطع اقدامات غيرشرعی، غيرقانونی و غيراخلاقی تاثيرگذار از سوی برخی دستگاه‌ها و برخلاف وصيت نامه حضرت امام خمينی (ره) در انتخابات صورت گرفته است.( اشاره به نقش نيروهای نظامی دراين تخلفات). درهمين راستا بود كه هاشمی رفسنجانی به عنوان يكی از كانديداهای اين انتخابات در اولين روز پس از برگزاری آن طی بيانيه‌ای به تخلفات اشاره و اعتراض كرد.

هاشمی رفسنجانی در اولين موضع‌گيری رسمي‌اش درباره‌ نتيجه دور دوم انتخابات رياست جمهوری عنوان كرد: «بنا ندارم كه در مورد انتخابات، شكايت به داورانی كه نشان دادند نمي‌خواهند يا نمي‌توانند كاری كنند، ببرم.»

ممكن است بسياری، اين نوع اظهارات را نشان از عزم قطعی هاشمی در عدم شكايت از متخلفان انتخاباتی بدانند، اما شايد سخنان هاشمی در خطبه‌های نماز جمعه هفته گذشته تهران كه در آن صراحتا تخريب‌های اين دور از انتخابات را در رديف يكی از فصل‌های غمگين آن قرار داد، دليلی بر اين باشد كه رييس مجمع تشخيص مصلحت نظام نيز خواهان مجازات افرادی است كه به گفته بسياری اقدامات غيرشرعی، غيرقانونی و غير اخلاقی مخالف با وصيت نامه حضرت امام خمينی (ره) را مرتكب شده‌اند و بنا به اظهارات هاشمی، چون عزم جدی در برخورد با آنها از جانب مجريان امر انتخابات مشاهده نمي‌كند روش دادخواهی بردن به دادگاه عدل الهی را در پيش گرفته است.

در همين ارتباط، رييس سازمان قضايی نيروهای مسلح با تاكيد بر اين‌كه در دو مرحله انتخابات، گزارشاتی از تخلفات نيروهای مسلح دريافت شد، تعداد آنها را 110 مورد اعلام كرد و اظهار داشت: ممكن است در مرحله بررسی مشخص شود بسياری از اين تخلفات صحت نداشته است.

حجت‌الاسلام رييسی، معاون اول رييس قوه قضاييه نيز پيش از برگزاری مرحله دوم انتخابات اعلام كرد: در طول انتخابات شكايت‌هايی مطرح شده كه افراد نظامی و انتظامی در انتخابات دخالت داشته‌اند، پرونده‌های آن، بخشی در سازمان قضايی نيروهای مسلح و بخشی در دادسرای عمومی تهران در حال رسيدگی است.

در حال حاضر به گفته نماينده‌ی رييس قوه‌ قضاييه در رسيدگی به تخلفات انتخاباتی، 107پرونده در اين حوزه در سراسر كشور تشكيل‌شده است و كار رسيدگی به آنها از بدو تشكيل در دوران انتخابات آغاز شده و بنا بر اظهارات حجت‌الاسلام زرگر تا يك ماه آينده، نتيجه‌ بررسي‌های انجام‌شده در اين زمينه اعلام مي‌شود.

با وجود اين مساله، خاتمی، رييس‌جمهور شنبه گذشته در جريان گشايش طرح توسعه حرم حضرت معصومه (س) در قم اعلام كرد: اعتراف مي‌كنم وضعيت اخلاق، به‌خصوص در سطح رسمی كشور مطلوب نيست. امروز دروغ‌گفتن، تهمت و تخريب عليه يك انسان مسلمان به سادگی آب خوردن است و با كمال تاسف، اين هنجارشكني‌ها و بداخلاقي‌ها گاهی به نام اسلام و انقلاب و ارزش‌ها انجام مي‌شود و حتی متاسفم كه بگويم در قم به نام دفاع از مكتب، بداخلاقي‌ها تئوريزه مي‌شود. ( اشاره مستقيم به مصباح يزدی و بنيادی كه بنام تحقيقات برپا كرده است)

شايد اين نوع اظهارات رييس‌جمهور و تاكيدات مكرر وی بر لزوم خشكاندن ريشه‌ بداخلاقي‌های انتخاباتی به همراه تمام بحث‌هايی كه درباره عزم جدی مسوولان قضايی در برخورد با تخلفات انتخاباتی مطرح مي‌شود، آغازی برای برخورد قاطع با تخلفات انتخاباتی كه در اين دور از انتخابات شكل گرفت؛ باشد.