همزمان با محاکمه شهرام امیری، که در عربستان ناپدید شد، در امریکا ظاهر شد و به ایران بازگشت، رئيس سازمان حفاظت اطلاعات وزارت دفاع جمهوری اسلامی برکنار شد. پیشتر معاون وزارت دفاع "عسگری" درجریان بازگشت از سوریه، در ترکیه ناپدید شده و سر از اسرائیل و امریکا در آورده بود. شهرام امیری نیز که گفته می شود مسئول سایت اتمی قم بوده، با لب تاپ خود راهی حج عمره در عربستان سعودی شده بود که چند روز بعد از ورود به عربستان ناپدید شد. گفته می شود اطلاعات اولیه درباره سایت اتمی قم را وی در اختیار امریکائی ها  و یا فرانسوی ها گذاشت. وقتی شهرام امیری به ایران بازگشت از او بعنوان قهرمان اتمی استقبال کردند اما پس از چند روز اخبار مرتبط با او از رسانه ها جمع شد و محاکمه محرمانه او به جرم افشای اطلاعات محرمانه جمهوری اسلامی آغاز شد.

با آنکه هیچ دلیلی برای برکناری رئیس حفاظت اطلاعات وزارت دفاع ذکر نشده، اما احتمال قریب به یقین وجود دارد که این برکناری در ارتباط با اطلاعاتی است که امیری در بازجوئی های خود پس از بازگشت به ایران در اختیار مقامات گذاشته است. اگر چنین باشد، آنگاه گوشه ای از نفوذ سازمان های جاسوسی اسرائیل و امریکا و کشورهای دیگر در اعماق نهادهای محرمانه جمهوری اسلامی فاش شده است!

آن که برکنار شد سردار سرتیپ دوم علی شیرازی نامه داشت و آن که به جای وی منصوب شد حجت‌الاسلام رمضاني نام دارد. رمضانی پيش از اين در حفاظت اطلاعات نيروهاي مسلح کار می کرده است.